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En 2030, un arqueólogo llega al Círculo Polar Ártico para continuar el trabajo de su recién fallecida hija.​ Allí, los investigadores están estudiando secretos que ha desenterrado el permafrost derretido; entre​ ellos, los restos perfectamente conservados de una niña que parece haber muerto de un virus antiguo​...

Una vez desatada, la peste ártica se extenderá por el mundo y cambiará la vida en la tierra para​ las generaciones venideras, por lo que la humanidad se verá obligada a idear formas innovadoras​ de afrontar la tragedia. En un parque temático diseñado para niños con enfermedades terminales,​ un cínico empleado se enamora de una madre desesperada por aferrarse a su hijo infectado. Un​ científico desconsolado encuentra una segunda oportunidad de paternidad cuando uno de sus sujetos de ensayos médicos, un cerdo, desarrolla la capacidad del habla. Una pintora viuda y su nieta​ adolescente se embarcan en la búsqueda cósmica de un nuevo planeta natal​...

Desde rascacielos funerarios hasta hoteles para muertos, Sequoia Nagamatsu alterna uno​s escenarios fascinantes con una galería de personajes que se entrelazan a lo largo de los siglos​ mientras la humanidad lucha por reconstruirse tras una pandemia. Al final de la oscuridad es una​ historia única sobre la resistencia del espíritu humano y nuestra capacidad infinita para soñar.